configure.in: removed doc dir.

Makefile.am

@@ -2,13 +2,13 @@
 demodir = demo
 
 demo_DATA = \
-						demo/vigenere.txt \
-						demo/afine.txt \
-						demo/plaintext.txt \
-						demo/vigenere.2.txt \
-						demo/vigenere.3.txt
+	    demo/vigenere.txt \
+	    demo/affine.txt \
+	    demo/plaintext.txt \
+	    demo/vigenere.2.txt \
+	    demo/vigenere.3.txt
 
-SUBDIRS = src data doc
+SUBDIRS = src data
 
 
 EXTRA_DIST = INSTALL README doxygen.conf autogen \

README

@@ -1,244 +0,0 @@
-# CryptAffinity
-
-## 1. Description
-
-CryptAffinity est un logiciel libre permettant de déchiffrer des texte
-obfusqués par des systemes Afines ou l'algorithme de Vigenère. Il possède les
-caractéristiques suivantes :
-
-  * Il est distribue sous la licence [GNU General Public License](http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html)
-  * Il est écrit en C++.
-  * Il implémente pour l'instant uniquement une analyse par fréquences, à partir d'une liste de "priorités" de lettres dans un texte clair, et de la proportion que représentent les X premières lettres "prioritaires" dans le texte.
-
-### 1.1. Auteurs
-
-CryptAffinity a été concçu et realisé par Glenn ROLLAND
-<[glenux@glenux.net](mailto:glenux@glenux.net)> et Roland LAURÈS
-<[shamox@mac.com](mailto:shamox@mac.com)> à l'occasion de travaux pratiques du
-cours de système du Master 2 Ingenierie Informatique - Systèmes, Reseaux et
-Internet.
-
-
-## 2. Pre-requis
-
-CryptAffinity nécessite les bibliothèques de fonctions suivantes (dans leur
-version de développement si compilez le programme vous-même):
-
-  * glib-2.0
-
-
-### 2.1. Sur un système Debian GNU/Linux
-
-Il vous suffit de taper (en tant qu'administrateur) les commandes suivantes
-pour installer le nécessaire: 
-
-    # apt-get install libglib-2.0-dev
-
-
-### 2.2. Sur un système Apple MacOS X (>= 10.3)
-
-Il est nécessaire d'avoir installé les autotools (automake,
-autoconf...) dans leur dernière version. À partir de là, il
-suffit de taper les commandes suivantes dans un terminal :
-
-    # sudo fink install glib2-dev
-
-
-### 2.3. Sur un système Microsoft Windows
-
-Cela ne fut pas testé, mais il est probable que cela
-fonctionne sous Cygwin ou équivalent.
-
-
-## 3. Se procurer CryptAffinity
-
-Vous pouvez télécharger la version la plus récente du projet sur le depôt Git du projet.
-
-Afin d'obtenir les sources, il vous suffit d'avoir Git installé sur votre système et de taper la commande suivante :
-
-    $ git clone https://github.com/glenux/cryptaffinity.git
-
-
-## 4. Utiliser CryptAffinity
-
-
-### 4.1. Compilation
-
-Si vous avez téléchargé une archive, commencez par la décompressez :
-
-    $ tar -xzvf CryptAffinity-0.2.tar.gz
-
-Rendez vous ensuite dans le dossier qui vient d'etre crée lors de la
-décompression.
-
-    $ cd CryptAffinity-0.2
-
-Puis lancez l'auto-configuration du logiciel, puis la compilation.
-
-    $ ./autogen
-    $ ./configure
-    $ make
-
-Le programme sous forme binaire se trouvera alors dans le sous-dossier
-src/tools/, sous le nom break_affinity
-
-
-### 4.2. Utilisation
-
-CryptAffinity necessite de nombreux parametres, avec la syntaxe suivante:
-
-    Usage: break_affinity -a <fichier> -e <float> -f <float> -p <fichier> -t <fichier> -m
-
-Ou les parametres sont les suivants:  &nbs
-p_place_holder;   
-
-**-a**, **--alphabet** _FILE_
-: Fichier contenant les lettres de l'alphabet, dans l'ordre.
-
-**-e**, **--epsilon** _FLOAT_
-: Tolerance pour le test des clefs.
-
-**-f**, **--frequencies** _FLOAT_
-: Proportion moyenne que représentent les 9 lettres "prioritaires" dans le texte
-clair.
-
-**-k**, **--keylength** _UINT_
-: Taille de la clef maximum (obsolète)
-
-**-p**, **--priorities** _FILE_
-: Lettres ordonnées par fréquence décroissante d'apparition dans le texte clair.
-
-**-t**, **--text** _FILE_
-: Fichier contenant le texte chiffre.
-
-**-m**, **--mode** _MODE_
-: Sélection du mode "Affine" (a) ou "Vigenère" (v)
-
-
-### 4.3. Exemples
-
-Pour utiliser le décodeur Affine : 
-
-    break_affinity -a data/alphabet.txt -f 0.7 -m a -p data/priority.txt \
-        -t demo/afine.txt -e 0.1
-
-Pour utiliser le décodeur Vigenère : 
-
-    break_afinity -a data/alphabet.txt -f 0.7 -m v -p data/priority.txt \
-        -t demo/vigenere.txt -e 0.05
-
-
-## 5. Documentation
-
-### 5.1. Code
-
-Vous pouvez générer la documentation du code de CryptAffinity avec doxygen
-et la consulter dans le dossier doc/html de l'application.
-
-Pour ce faire, tapez :
-
-    $ doxygen doxygen.conf
-
-
-### 5.2. Principe du "décodeur Affine"
-
-On génère l'espace des clefs possibles pour l'alphabet donne
-en entrée:
-
-    int alpha_size; //taille de l'alphabet
-    std::list<int> orb; // nombre premiers avec alpha_size
-    MathTools mt; // bibliotheque d'outils mathematiques
-    std::list<KeyAfine> keyList;
-    std::list<int>::iterator orbIt;
-    
-    for (i=1; i<alpha_size; i++){
-        if (mt.pgcd(i, alpha_size) == 1) {
-    	orb.push_back(i);
-        }
-    }
-    // 1 - generer l'espace des 312 clefs
-    for (orbIt = orb.begin(); orbIt != orb.end(); orbIt++){
-        KeyAfine key;
-        key.setCoefA((*orbIt));
-        for (i=0; i<alpha_size; i++){
-    	key.setCoefB(i);
-    	keyList.push_back(key);
-      }
-    }
-
-
-Puis on fait une attaque par analyse de frequence sur les textes obtenus par
-"décodage" du texte chiffre avec les clefs essayees.
-
-    float frequencies; // frequence cumulee des 9 lettres les
-    plus presentes
-    float epsilon; // marge d'erreur
-    std::list<KeyAfine>::iterator kLIt;
-  
-    for (kLIt = keyList.begin(); kLIt != keyList.end(); kLIt++){
-        float score = 0;
-        printf("Trying key %s\n", (*kLIt).toString().c_str());
-  
-        plainText = codec.decode(cypherText, *kLIt);   
-        plainText.setAlphabet(this->_config.getAlphabet());
-  
-        for (int i=0; i<9; i++){
-	    score +=   plainText.getCountOf(prio_conf[i]);
-        }
-  
-        score = score / plainText.size();
-  
-        if (fabs(score - frequencies) < epsilon){
-	    printf("KEY = %s\n",(*kLIt).toString().c_str());
-  
-	    printf("PLAIN TEXT(%f) = %s\n", fabs(score-frequencies),
-  
-		    plainText.toAlphabet().c_str());
-        }
-    }
-  
-
-### 5.3. Principe du "décodeur Vigenère"
-
-On commence par détecter les groupes de carateres qui se repetent dans le
-texte.
-
-Une fois ces groupes repétes de lettres obtenus (dans l'ordre décroissant en
-fonction de leur longueur), on calcule la distance separant les deux premiers
-groupes (note d1) puis la distance entre les deux suivant (d2).
-
-On pose K = PGCD(d1, d2). Il est fortement probable que K soit un multiple de
-la longueur de la clef. L'hypothese sous-jacente est que ces groupes de
-lettres sont issue du chiffrement des memes bouts de mots avec les memes bouts
-de la clef. Si le K = 1 on peut raisonnablement supposer que ce n'est pas le
-cas, et qu'il n'y a pas de repetitions.
-
-
-L'etape suivante consiste a faire une analyse de frequence en découpant le
-texte en K colonnes. On classe ensuite les lettres
-apparaissant dans les colonnes en fonction de leur nombre d'apparitions.
-
-Dans un monde utopique, il suffirait de calculer la distance entre la lettre
-apparaissant le plus souvent dans la colonne, et celle apparaissant le plus
-souvent dans le langage attendu pour le texte clair (l'anglais en
-l'occurrence).
-
-Cependant il arrive frequemment que l'ordre de lettre soit legerement change
-par rapport au resultat attendu. Dans le programme, on calcule donc pour
-chaque colonne les distances entre les X lettres les plus frequentes dans la
-colonne et la lettre la plus frequente dans le langage.
-
-On génère ensuite un espace de X ^ K clefs a partir des combinaisons de ces
-differents décalages obtenus sur chaque colonne.
-
-  
-Enfin, on décode ensuite le texte avec chacune des clef génerees, et en
-fonction de donnees statistiques relative a notre connaissance prealable du
-texte et d'une petite marge d'erreur, on filtre les texte déchiffres.
-
-(Exemple: les 9 lettres les plus frequentes representent 70% du texte, et on
-une marge de +/- 4%).
-
-En jouant sur la marge d'erreur, on laisse passer plus ou moins de textes
-déchiffres, parmi lesquels devrait se trouver le texte clair attendu.
-

README.md

@@ -0,0 +1,244 @@
+# CryptAffinity
+
+## 1. Description
+
+CryptAffinity est un logiciel libre permettant de déchiffrer des texte
+obfusqués par des systemes Affines ou l'algorithme de Vigenère. Il possède les
+caractéristiques suivantes :
+
+  * Il est distribue sous la licence [GNU General Public License](http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html)
+  * Il est écrit en C++.
+  * Il implémente pour l'instant uniquement une analyse par fréquences, à partir d'une liste de "priorités" de lettres dans un texte clair, et de la proportion que représentent les X premières lettres "prioritaires" dans le texte.
+
+### 1.1. Auteurs
+
+CryptAffinity a été concçu et realisé par Glenn ROLLAND
+<[glenux@glenux.net](mailto:glenux@glenux.net)> et Roland LAURÈS
+<[shamox@mac.com](mailto:shamox@mac.com)> à l'occasion de travaux pratiques du
+cours de système du Master 2 Ingenierie Informatique - Systèmes, Reseaux et
+Internet.
+
+
+## 2. Pre-requis
+
+CryptAffinity nécessite les bibliothèques de fonctions suivantes (dans leur
+version de développement si compilez le programme vous-même):
+
+  * glib-2.0
+
+
+### 2.1. Sur un système Debian GNU/Linux
+
+Il vous suffit de taper (en tant qu'administrateur) les commandes suivantes
+pour installer le nécessaire: 
+
+    # apt-get install libglib-2.0-dev
+
+
+### 2.2. Sur un système Apple MacOS X (>= 10.3)
+
+Il est nécessaire d'avoir installé les autotools (automake,
+autoconf...) dans leur dernière version. À partir de là, il
+suffit de taper les commandes suivantes dans un terminal :
+
+    # sudo fink install glib2-dev
+
+
+### 2.3. Sur un système Microsoft Windows
+
+Cela ne fut pas testé, mais il est probable que cela
+fonctionne sous Cygwin ou équivalent.
+
+
+## 3. Se procurer CryptAffinity
+
+Vous pouvez télécharger la version la plus récente du projet sur le depôt Git du projet.
+
+Afin d'obtenir les sources, il vous suffit d'avoir Git installé sur votre système et de taper la commande suivante :
+
+    $ git clone https://github.com/glenux/cryptaffinity.git
+
+
+## 4. Utiliser CryptAffinity
+
+
+### 4.1. Compilation
+
+Si vous avez téléchargé une archive, commencez par la décompressez :
+
+    $ tar -xzvf CryptAffinity-0.2.tar.gz
+
+Rendez vous ensuite dans le dossier qui vient d'etre crée lors de la
+décompression.
+
+    $ cd CryptAffinity-0.2
+
+Puis lancez l'auto-configuration du logiciel, puis la compilation.
+
+    $ ./autogen
+    $ ./configure
+    $ make
+
+Le programme sous forme binaire se trouvera alors dans le sous-dossier
+src/tools/, sous le nom break_affinity
+
+
+### 4.2. Utilisation
+
+CryptAffinity necessite de nombreux parametres, avec la syntaxe suivante:
+
+    Usage: break_affinity -a <fichier> -e <float> -f <float> -p <fichier> -t <fichier> -m
+
+Ou les parametres sont les suivants:  &nbs
+p_place_holder;   
+
+**-a**, **--alphabet** _FILE_
+: Fichier contenant les lettres de l'alphabet, dans l'ordre.
+
+**-e**, **--epsilon** _FLOAT_
+: Tolerance pour le test des clefs.
+
+**-f**, **--frequencies** _FLOAT_
+: Proportion moyenne que représentent les 9 lettres "prioritaires" dans le texte
+clair.
+
+**-k**, **--keylength** _UINT_
+: Taille de la clef maximum (obsolète)
+
+**-p**, **--priorities** _FILE_
+: Lettres ordonnées par fréquence décroissante d'apparition dans le texte clair.
+
+**-t**, **--text** _FILE_
+: Fichier contenant le texte chiffre.
+
+**-m**, **--mode** _MODE_
+: Sélection du mode "Affine" (a) ou "Vigenère" (v)
+
+
+### 4.3. Exemples
+
+Pour utiliser le décodeur Affine : 
+
+    break_affinity -a data/alphabet.txt -f 0.7 -m a -p data/priority.txt \
+        -t demo/affine.txt -e 0.1
+
+Pour utiliser le décodeur Vigenère : 
+
+    break_afinity -a data/alphabet.txt -f 0.7 -m v -p data/priority.txt \
+        -t demo/vigenere.txt -e 0.05
+
+
+## 5. Documentation
+
+### 5.1. Code
+
+Vous pouvez générer la documentation du code de CryptAffinity avec doxygen
+et la consulter dans le dossier doc/html de l'application.
+
+Pour ce faire, tapez :
+
+    $ doxygen doxygen.conf
+
+
+### 5.2. Principe du "décodeur Affine"
+
+On génère l'espace des clefs possibles pour l'alphabet donne
+en entrée:
+
+    int alpha_size; //taille de l'alphabet
+    std::list<int> orb; // nombre premiers avec alpha_size
+    MathTools mt; // bibliotheque d'outils mathematiques
+    std::list<KeyAffine> keyList;
+    std::list<int>::iterator orbIt;
+    
+    for (i=1; i<alpha_size; i++){
+        if (mt.pgcd(i, alpha_size) == 1) {
+    	orb.push_back(i);
+        }
+    }
+    // 1 - generer l'espace des 312 clefs
+    for (orbIt = orb.begin(); orbIt != orb.end(); orbIt++){
+        KeyAffine key;
+        key.setCoefA((*orbIt));
+        for (i=0; i<alpha_size; i++){
+    	key.setCoefB(i);
+    	keyList.push_back(key);
+      }
+    }
+
+
+Puis on fait une attaque par analyse de frequence sur les textes obtenus par
+"décodage" du texte chiffre avec les clefs essayees.
+
+    float frequencies; // frequence cumulee des 9 lettres les
+    plus presentes
+    float epsilon; // marge d'erreur
+    std::list<KeyAffine>::iterator kLIt;
+  
+    for (kLIt = keyList.begin(); kLIt != keyList.end(); kLIt++){
+        float score = 0;
+        printf("Trying key %s\n", (*kLIt).toString().c_str());
+  
+        plainText = codec.decode(cypherText, *kLIt);   
+        plainText.setAlphabet(this->_config.getAlphabet());
+  
+        for (int i=0; i<9; i++){
+	    score +=   plainText.getCountOf(prio_conf[i]);
+        }
+  
+        score = score / plainText.size();
+  
+        if (fabs(score - frequencies) < epsilon){
+	    printf("KEY = %s\n",(*kLIt).toString().c_str());
+  
+	    printf("PLAIN TEXT(%f) = %s\n", fabs(score-frequencies),
+  
+		    plainText.toAlphabet().c_str());
+        }
+    }
+  
+
+### 5.3. Principe du "décodeur Vigenère"
+
+On commence par détecter les groupes de carateres qui se repetent dans le
+texte.
+
+Une fois ces groupes repétes de lettres obtenus (dans l'ordre décroissant en
+fonction de leur longueur), on calcule la distance separant les deux premiers
+groupes (note d1) puis la distance entre les deux suivant (d2).
+
+On pose K = PGCD(d1, d2). Il est fortement probable que K soit un multiple de
+la longueur de la clef. L'hypothese sous-jacente est que ces groupes de
+lettres sont issue du chiffrement des memes bouts de mots avec les memes bouts
+de la clef. Si le K = 1 on peut raisonnablement supposer que ce n'est pas le
+cas, et qu'il n'y a pas de repetitions.
+
+
+L'etape suivante consiste a faire une analyse de frequence en découpant le
+texte en K colonnes. On classe ensuite les lettres
+apparaissant dans les colonnes en fonction de leur nombre d'apparitions.
+
+Dans un monde utopique, il suffirait de calculer la distance entre la lettre
+apparaissant le plus souvent dans la colonne, et celle apparaissant le plus
+souvent dans le langage attendu pour le texte clair (l'anglais en
+l'occurrence).
+
+Cependant il arrive frequemment que l'ordre de lettre soit legerement change
+par rapport au resultat attendu. Dans le programme, on calcule donc pour
+chaque colonne les distances entre les X lettres les plus frequentes dans la
+colonne et la lettre la plus frequente dans le langage.
+
+On génère ensuite un espace de X ^ K clefs a partir des combinaisons de ces
+differents décalages obtenus sur chaque colonne.
+
+  
+Enfin, on décode ensuite le texte avec chacune des clef génerees, et en
+fonction de donnees statistiques relative a notre connaissance prealable du
+texte et d'une petite marge d'erreur, on filtre les texte déchiffres.
+
+(Exemple: les 9 lettres les plus frequentes representent 70% du texte, et on
+une marge de +/- 4%).
+
+En jouant sur la marge d'erreur, on laisse passer plus ou moins de textes
+déchiffres, parmi lesquels devrait se trouver le texte clair attendu.
+

configure.in

@@ -16,21 +16,21 @@ dnl Foundation, Inc., 59 Temple Place - Suite 330, Boston, MA 02111-1307, USA.
 dnl 
 
 ## Autoconf requirements
-AC_INIT([CryptAfinity], [0.2], [glenux@fr.st])
+AC_INIT([CryptAffinity], [0.2], [glenux@glenux.net])
 AC_PREREQ(2.50)
 
 AC_CANONICAL_HOST
 AC_CANONICAL_TARGET
 
 
-AM_INIT_AUTOMAKE([CryptAfinity],[0.2])
+AM_INIT_AUTOMAKE([CryptAffinity],[0.2])
 
 #AC_CANONICAL_SYSTEM
 
 
 
 AM_CONFIG_HEADER(src/config.h)
-AC_CONFIG_SRCDIR([src/lib/cryptafinity.hh])
+AC_CONFIG_SRCDIR([src/lib/cryptaffinity.hh])
 AC_PROG_INSTALL
 
 ## information on the package
@@ -128,7 +128,6 @@ AC_SUBST(GLIB2_LIBS)
 #AC_SUBST(TARGET_HAVE_READLINE)
 
 AC_CONFIG_FILES([Makefile 
-		doc/Makefile
 		data/Makefile
 		src/Makefile 
 		src/lib/Makefile 

doc/Makefile.am

@@ -1,10 +0,0 @@
-
-cryptafinityhtmldir = $(docdir)/cryptafinity/html
-
-cryptafinityhtml_DATA = \
-					   html/index.html \
-					   html/cryptafinity.css 
-
-EXTRA_DIST = \
-			 $(cryptafinityhtml_DATA)
-

doc/html/cryptafinity.css

@@ -1,36 +0,0 @@
-
-/* Generated by CaScadeS, a stylesheet editor for Mozilla Composer */
-
-  p.code { border: 2px dashed rgb(153, 153, 153);
-    padding: 5px;
-    background: rgb(204, 204, 204) none repeat scroll 0% 50%;
-    -moz-background-clip: initial;
-    -moz-background-origin: initial;
-    -moz-background-inline-policy: initial;
-    font-family: monospace;
-    }
-
-@media screen {
-  div.page { border: 2px dashed rgb(153, 153, 153);
-    padding: 10px;
-    top: 10px;
-    left: 10px;
-    right: 10px;
-    bottom: 10px;
-    margin-right: auto;
-    margin-left: auto;
-    background-color: rgb(255, 255, 255);
-    opacity: 1;
-    width: 60%;
-    font-family: Arial,Helvetica,sans-serif;
-    }
-
-  body { background-color: rgb(51, 51, 51);
-    }
-}
-
-  span.code { border: 1px dashed rgb(153, 153, 153);
-    background-color: rgb(204, 204, 204);
-    font-family: monospace;
-    }
-

doc/html/index.html

@@ -1,456 +0,0 @@
-<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
-<html lang="fr-fr"><head>
-
-  
-  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
-
-
-  
-  <link rel="stylesheet" type="text/css" href="cryptafinity.css">
-
-  
-
-  
-  
-  <title>CryptAfinity</title><meta content="Glenn ROLLAND" name="author"></head>
-
-<body style="direction: ltr;">
-
-<div style="text-align: justify;" class="page code">
-<h1>CryptAfinity</h1>
-
-<ol>
-
-  <li><a href="#1._Description">Description</a></li>
-
-  <ol>
-
-    <li><a href="#1.1._Auteurs">Auteurs</a></li>
-
-  </ol>
-
-  <li><a href="#2._Pr%E9-requis">Pr&eacute;-requis</a></li>
-
-  <ol>
-
-    <li><a href="#2.1._Sur_un_syst%E8me_Debian_GNULinux">Sur un
-syst&egrave;me Debian GNU/Linux</a></li>
-
-    <li><a href="#2.2._Sur_un_syst%E8me_Apple_MacOS_X_">Sur un
-syst&egrave;me Apple MacOSX (&ge;10.3)</a></li>
-
-    <li><a href="#2.3._Sur_un_syst%E8me_Microsoft_Windows">Sur
-un syst&egrave;me Microsoft Windows</a></li>
-
-  </ol>
-
-  <li><a href="#3._Se_procurer_MiniFTPc">Se procurer
-CryptAfinity</a></li>
-
-  <li><a href="#4._Utiliser_MiniFTPc">Utiliser CryptAfinity</a></li>
-
-  <ol>
-
-    <li><a href="#4.1._Compilation">Compilation</a></li>
-
-    <li><a href="#4.2._Utilisation">Utilisation</a></li>
-
-  </ol>
-
-  <li><a href="#5._Documentation">Documentation</a></li>
-  <ol>
-    <li><a href="#5.1._Code">Code</a></li>
-    <li><a href="#5.2._Principe_du_d%E9codeur_Afine">D&eacute;codeur "Afine"</a></li>
-    <li><a href="#5.3._Principe_du_d%E9codeur_Vigen%E8re">D&eacute;codeur "Vigen&egrave;re"</a></li>
-  </ol>
-
-
-</ol>
-
-<h2><a name="1._Description"></a>1.
-<a name="Description"></a>Description</h2>
-
-<p>CryptAfinity est un logiciel
-libre permettant de d&eacute;chiffrer des texte
-obfusqu&eacute;s par des syst&egrave;mes Afines ou l'algorithme
-de Vigen&egrave;re. Il poss&egrave;de les
-caract&eacute;ristiques
-suivantes :</p>
-
-<ul>
-
-  <li>Il est distribu&eacute;
-sous la licence&nbsp;<a href="http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html">GNU
-General Public License</a></li>
-
-  <li>Il est
-&eacute;crit en C++.</li>
-
-  <li>Il
-impl&eacute;mente
-pour l'instant uniquement une analyse par fr&eacute;quences,
-&agrave; partir d'une liste de "priorit&eacute;s" de lettres
-dans un texte clair, et de la proportion que repr&eacute;sentent
-les X premieres lettres "prioritaires" dans le texte.</li>
-
-</ul>
-
-<h3><span style="font-weight: bold;"></span>1.1.
-Auteurs</h3>
-
-<p>CryptAfinity a
-&eacute;t&eacute; enti&egrave;rement
-r&eacute;alis&eacute; par Glenn ROLLAND &lt;<a href="mailto:glenux@fr.st">glenux@fr.st</a>&gt; et Roland LAUR&Egrave;S &lt;<a href="mailto:shamox@mac.com">shamox@mac.com</a>&gt; 
-&agrave; l'occasion de travaux pratiques du cours de syst&egrave;me du
-Master 2 Ing&eacute;nierie Informatique -
-Syst&egrave;mes, R&eacute;seaux et Internet.</p>
-
-<h2><a name="2._Pr&eacute;-requis"></a>2.
-Pr&eacute;-requis</h2>
-
-<p>CryptAfinity
-n&eacute;cessite les biblioth&egrave;ques de fonctions
-suivantes (dans
-leur version de d&eacute;veloppement si compilez le programme
-vous-m&ecirc;me):</p>
-
-<ul>
-
-  <li>glib-2.0</li>
-
-</ul>
-
-<h3><a name="2.1._Sur_un_syst&egrave;me_Debian_GNULinux"></a>2.1.
-Sur un syst&egrave;me
-Debian GNU/Linux</h3>
-
-<p>Il vous suffit de taper (en
-tant qu'administrateur) les
-commandes suivantes pour installer le n&eacute;cessaire:&nbsp;</p>
-
-<p class="code"># apt-get
-install libglib-2.0-dev</p>
-
-<h3><a name="2.2._Sur_un_syst&egrave;me_Apple_MacOS_X_"></a>2.2.
-Sur un syst&egrave;me Apple MacOS X (&gt;= 10.3)</h3>
-
-<p>
-Il est n&eacute;cessaire d'avoir install&eacute; <span style="font-style: italic;"></span>les&nbsp;<span style="font-style: italic;">autotools</span>
-(automake, autoconf...) dans leur derni&egrave;re
-version.&nbsp;&Agrave; partir de l&agrave;, il suffit de
-taper les commandes suivantes dans un terminal :</p>
-
-<p class="code"># sudo fink
-install glib2-dev</p>
-
-<h3><a name="2.3._Sur_un_syst&egrave;me_Microsoft_Windows"></a>2.3.
-Sur un syst&egrave;me Microsoft Windows</h3>
-
-Cela ne fut pas (encore) test&eacute;, mais il est tr&egrave;s
-probable que cela fonctionne&nbsp;sous Cygwin.<br>
-
-<h2><a name="3._Se_procurer_MiniFTPc"></a>3.
-Se procurer CryptAfinity</h2>
-
-<p>
-Vous
-pouvez t&eacute;l&eacute;charger la derni&egrave;re archive
-des
-sources, ou bien directement la version la plus r&eacute;cente du
-projet sur le d&eacute;p&ocirc;t Subversion du projet.</p>
-
-<h3>3.1. L'archive des sources</h3>
-
-<p>
-Elle est disponible &agrave; l'adresse : </p>
-
-<a href="http://glenux2.free.fr/pub/projets/CryptAfinity/archives/">http://glenux2.free.fr/pub/projets/CryptAfinity/archives/</a><br>
-
-<h3>3.2. Le
-d&eacute;p&ocirc;t Subversion</h3>
-
-<p>Afin d'obtenir les sources les
-plus &agrave; jour, vous pouvez utiliser le logiciel de
-contr&ocirc;le de sources Subversion </p>
-
-<p class="code">$ svn
-checkout http://repository.glenux.ath.cx/svn/CryptAfinity/</p>
-
-<p>Il n'y a pas de mot de passe,
-il suffit donc de presser la touche
-"Entr&eacute;e" pour l'utilisateur "anonymous", si ce dernier vous
-est
-demand&eacute;.</p>
-
-<h2><a name="4._Utiliser_MiniFTPc"></a>4.
-Utiliser CryptAfinity</h2>
-
-<h3><a name="4.1._Compilation"></a>4.1.
-Compilation</h3>
-
-<p>Commencez par
-d&eacute;compressez l'archive.</p>
-
-<p class="code">$ tar -xzvf
-CryptAfinity-0.1.tar.gz</p>
-
-<p>Rendez vous ensuite dans le
-dossier qui vient d'&ecirc;tre cr&eacute;&eacute; lors de
-la d&eacute;compression.</p>
-
-<p class="code">$ cd
-CryptAfinity-0.2</p>
-
-<p>Puis lancez
-l'auto-configuration du logiciel, puis la compilation.</p>
-
-<p class="code">$ ./autogen<br>
-
-$ ./configure<br>
-
-$ make</p>
-
-<p>Le programme sous forme binaire
-se trouvera alors dans le sous-dossier <span class="code">src/tools/</span>,
-sous le nom <span class="code">break_afinity</span></p>
-
-<h3><a name="4.2._Utilisation"></a>4.2.
-Utilisation</h3>
-
-<p>
-CryptAfinity n&eacute;cessite de nombreux param&egrave;tres, avec la
-syntaxe suivante:</p>
-
-<p class="code">Usage:
-break_afinity -a &lt;fichier&gt; -e &lt;float&gt; -f
-&lt;float&gt; -p &lt;fichier&gt; -t
-&lt;fichier&gt; -m <br>
-
-</p>
-
-<p>
-O&ugrave; les param&egrave;tres sont les
-suivants:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</p>
-
-<table style="text-align: left; width: 100%;" border="0" cellpadding="2" cellspacing="2">
-
-  <tbody>
-
-    <tr>
-
-      <td>-a, --alphabet
-&lt;file&gt;&nbsp;</td>
-
-      <td>Fichier contenant les
-lettres de l'alphabet, dans l'ordre.</td>
-
-    </tr>
-
-    <tr>
-
-      <td><br>
-
--e, --epsilon &lt;float&gt;</td>
-
-      <td>Tolerance pour le test
-des clefs.</td>
-
-    </tr>
-
-    <tr>
-
-      <td>-f, --frequencies
-&lt;float&gt;</td>
-
-      <td>Proportion moyenne que
-repr&eacute;sentent les 9 lettres "prioritaires" dans le texte
-clair.</td>
-
-    </tr>
-
-    <tr>
-
-      <td>-k, --keylength
-&lt;int&gt;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;</td>
-
-      <td>Taille de la clef
-maximul (obsol&egrave;te)</td>
-
-    </tr>
-
-    <tr>
-
-      <td>-p, --priorities
-&lt;file&gt;</td>
-
-      <td>Lettres
-ordonn&eacute;es par fr&eacute;quence d&eacute;croissante
-d'apparition dans le texte clair.</td>
-
-    </tr>
-
-    <tr>
-
-      <td>-t, --text
-&lt;file&gt;</td>
-
-      <td>Fichier contenant le
-texte chiffr&eacute;.</td>
-
-    </tr>
-    <tr>
-
-      <td>-m, --mode &lt;a|v&gt;</td>
-
-      <td>Selection du mode "Afine" ou "Vigen&egrave;re"</td>
-
-    </tr>
-
-  </tbody>
-</table>
-
-<h2><a name="5._Documentation"></a>5.
-Documentation</h2>
-
-<h3><a name="5.1._Code"></a>5.1. Code</h3>
-
-<p>Vous pouvez trouver la documentation du code de CryptAfinity dans le
-dossier <span class="code">doc/html</span>
-de l'application, ou en suivant <a href="html/index.html">ce lien</a>.</p>
-
-<h3><a name="5.2._Principe_du_d&eacute;codeur_Afine"></a>5.2. Principe du "d&eacute;codeur Afine"</h3>
-
-<p>On g&eacute;n&egrave;re l'espace des&nbsp;clefs possibles pour l'alphabet donn&eacute; en entr&eacute;e:</p>
-
-<p class="code">int alpha_size; //taille de l'alphabet<br>
-
-std::list&lt;int&gt; orb; // nombre premiers avec alpha_size<br>
-
-MathTools mt; // bibliotheque d'outils math&eacute;matiques<br>
-
-std::list&lt;KeyAfine&gt; keyList;<br>
-
-std::list&lt;int&gt;::iterator orbIt;</p>
-
-<p class="code">for (i=1; i&lt;alpha_size; i++){<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; if (mt.pgcd(i, alpha_size) == 1) {<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; orb.push_back(i);<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
-
-}<br>
-
-// 1 - g&eacute;n&eacute;rer l'espace des 312 clefs<br>
-
-for (orbIt = orb.begin(); orbIt != orb.end(); orbIt++){<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; KeyAfine key;<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; key.setCoefA((*orbIt));<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; for (i=0; i&lt;alpha_size; i++){<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; key.setCoefB(i);<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; keyList.push_back(key);<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
-
-}</p>
-
-<p>Puis on fait une attaque par analyse de fr&eacute;quence sur les textes
-obtenus par "d&eacute;codage" du texte chiffr&eacute; avec les clefs essay&eacute;es.</p>
-
-<p class="code">float frequencies; // fr&eacute;quence cumul&eacute;e des&nbsp;9 lettres les plus pr&eacute;sentes<br>
-
-float epsilon; // marge d'erreur</p>
-
-<p style="text-align: left;" class="code">std::list&lt;KeyAfine&gt;::iterator kLIt;<br>
-
-for (kLIt = keyList.begin(); kLIt != keyList.end(); kLIt++){<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; float score = 0;<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; printf("Trying key %s\n", (*kLIt).toString().c_str());<br>
-
-<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; plainText = codec.decode(cypherText, *kLIt);&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; plainText.setAlphabet(this-&gt;_config.getAlphabet());<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; for (int i=0; i&lt;9; i++){<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; score += plainText.getCountOf(prio_conf[i]);<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; score = score / plainText.size();<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; if (fabs(score - frequencies) &lt; epsilon){<br>
-
-&nbsp; &nbsp; &nbsp; printf("KEY = %s\n",(*kLIt).toString().c_str());<br>
-
-&nbsp; &nbsp; &nbsp;&nbsp;printf("PLAIN TEXT(%f) = %s\n", fabs(score-frequencies),<br>
-
-&nbsp; &nbsp; &nbsp; &nbsp; plainText.toAlphabet().c_str());<br>
-
-&nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
-
-<br>
-
-}</p>
-
-
-<h3><a name="5.3._Principe_du_d&eacute;codeur_Vigen&egrave;re"></a>5.3. Principe du "d&eacute;codeur Vigen&egrave;re"</h3>
-<div style="text-align: justify;">
-On commence par faire r&eacute;cup&eacute;rer les groupes de carat&egrave;res qui se r&eacute;p&egrave;tent dans le texte.<br>
-
-<br>
-Une fois les groupes r&eacute;p&eacute;t&eacute;s de lettres de plus
-grande longueur obtenus (dans l'ordre d&eacute;croissant en fonction de
-la longueur), on calcule la distance
-s&eacute;parant les deux premiers groupes (note d1) puis la distance
-entre les deux suivant (d2). <br>
-On pose K = PGCD(d1, d2). Il est fortement probable que K soit un
-multiple de la longueur de la clef. L'hypoth&egrave;se sous-jacente est
-que ces groupes de lettres sont issue du chiffrement des m&ecirc;mes
-bouts de mots avec les m&ecirc;mes bouts de la clef. Si le K = 1 on
-peut raisonnablement supposer que ce n'est pas le cas, et qu'il n'y a pas de r&eacute;p&eacute;titions.<br>
-
-<br>
-L'&eacute;tape suivante consiste &agrave; faire une analyse de
-fr&eacute;quence en d&eacute;coupant le texte en K&nbsp;colonnes. On
-classe ensuite les lettres apparaissant dans les colonnes en fonction
-de leur nombre d'apparitions. <br>
-Dans un monde utopique, il suffirait de calculer la distance entre la
-lettre apparaissant le plus souvent dans la colonne, et celle
-apparaissant le plus souvent dans le langage attendu pour le texte
-clair (l'anglais en l'occurrence). <br>
-Cependant il arrive fr&eacute;quemment que l'ordre de lettre soit
-l&eacute;g&egrave;rement chang&eacute; par rapport au r&eacute;sultat
-attendu. Dans le programme, on calcule donc pour chaque colonne les
-distances entre les X lettres les plus fr&eacute;quentes dans la
-colonne et la lettre la plus fr&eacute;quente dans le langage.<br>
-On g&eacute;n&egrave;re ensuite un espace de X ^ K clefs a partir des
-combinaisons de ces diff&eacute;rents d&eacute;calages obtenus sur
-chaque colonne.<br>
-<br>
-Enfin, on d&eacute;code ensuite le texte avec chacune des clef
-g&eacute;n&eacute;r&eacute;es, et en fonction de donn&eacute;es
-statistiques
-relative &agrave; notre connaissance pr&eacute;alable du texte et d'une
-petite marge d'erreur, on filtre les texte d&eacute;chiffr&eacute;s.<br>
-(Exemple: les 9 lettres les plus fr&eacute;quentes repr&eacute;sentent 70% du texte, et on une marge de +/- 4%). <br>
-En jouant sur la marge d'erreur, on laisse passer plus ou moins de
-textes d&eacute;chiffr&eacute;s, parmi lesquels devrait se trouver le
-texte clair attendu.<br>
-
-
-</div>
-</div>
-
-
-</body></html>

src/lib/Makefile.am

@@ -1,37 +1,37 @@
 SUBDIRS = .
 
-lib_LTLIBRARIES = libcryptafinity.la
+lib_LTLIBRARIES = libcryptaffinity.la
 
 #bin_PROGRAMS = libulm.o
 
-libcryptafinity_la_SOURCES = 	alphabet.cpp \
+libcryptaffinity_la_SOURCES = 	alphabet.cpp \
 	key.cpp \
 	text.cpp \
 	codec.cpp \
 	letter.cpp \
-	codec_afine.cpp \
+	codec_affine.cpp \
 	codec_vigenere.cpp \
-	key_afine.cpp \
+	key_affine.cpp \
 	key_vigenere.cpp \
 	word_list.cpp \
 	math_tools.cpp \
 	freq_analyser.cpp
 
-#libcryptafinity_la_SOURCES += cryptafinity_errors.hh \
-#	cryptafinity_global.hh \
-#	cryptafinity.hh \
-#	cryptafinity_iface.hh \
-#	cryptafinity_proto.hh \
+#libcryptaffinity_la_SOURCES += cryptaffinity_errors.hh \
+#	cryptaffinity_global.hh \
+#	cryptaffinity.hh \
+#	cryptaffinity_iface.hh \
+#	cryptaffinity_proto.hh \
 #	XSock.hh
 
-libcryptafinity_la_CFLAGS = -DTRACE -static
-libcryptafinity_la_LDFLAGS = -version-info 3:12:1
+libcryptaffinity_la_CFLAGS = -DTRACE -static
+libcryptaffinity_la_LDFLAGS = -version-info 3:12:1
 
 #INCLUDES=  	SQLITE3_CFLAGS@ \
 #			LIBXMLPP_CFLAGS@ \
 #			-I./
 
-#libcryptafinity_a_LDFLAGS= @LDFLAGS@ 
+#libcryptaffinity_a_LDFLAGS= @LDFLAGS@ 
 
 #SQLITE3_LIBS@ LIBPCRE_LIBS@
 

src/lib/alphabet.cpp

@@ -1,7 +1,7 @@
 
 #include "alphabet.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 
 	Alphabet::Alphabet() : std::vector<std::string>() { }
 

src/lib/alphabet.hh

@@ -1,11 +1,11 @@
-#ifndef _LIBCRYPAFINITY_ALPHABET_HH
-#define _LIBCRYPAFINITY_ALPHABET_HH
+#ifndef _LIBCRYPAFFINITY_ALPHABET_HH
+#define _LIBCRYPAFFINITY_ALPHABET_HH
 
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class ReverseAlphabet: public std::map<std::string, int> {
 	};
 

src/lib/codec.cpp

@@ -1,7 +1,7 @@
 
 #include "codec.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	Codec::Codec(){
 	}
 

src/lib/codec.hh

@@ -1,13 +1,13 @@
-#ifndef _LIBCRYPAFINITY_CODEC_HH
-#define _LIBCRYPAFINITY_CODEC_HH
+#ifndef _LIBCRYPAFFINITY_CODEC_HH
+#define _LIBCRYPAFFINITY_CODEC_HH
 
 
 #include "text.hh"
 #include "key.hh"
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class Codec {
 		private:
 		public:

src/lib/codec_affine.cpp

@@ -1,8 +1,8 @@
 
-#include "codec_afine.hh"
+#include "codec_affine.hh"
 #include "math_tools.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	CodecAfine::CodecAfine() : Codec() {
 	}
 

src/lib/codec_affine.hh

@@ -0,0 +1,23 @@
+#ifndef _LIBCRYPAFFINITY_CODEC_AFINE_HH
+#define _LIBCRYPAFFINITY_CODEC_AFINE_HH
+
+#include "codec.hh"
+#include "key_affine.hh"
+
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
+
+
+namespace LibCryptAffinity {
+	class CodecAfine : public Codec {
+		private:
+		public:
+			CodecAfine();
+			
+			Text encode(Text t, KeyAfine k);
+			Text decode(Text t, KeyAfine k);
+
+	};
+}
+
+#endif

src/lib/codec_afine.hh

@@ -1,23 +0,0 @@
-#ifndef _LIBCRYPAFINITY_CODEC_AFINE_HH
-#define _LIBCRYPAFINITY_CODEC_AFINE_HH
-
-#include "codec.hh"
-#include "key_afine.hh"
-
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
-
-
-namespace LibCryptAfinity {
-	class CodecAfine : public Codec {
-		private:
-		public:
-			CodecAfine();
-			
-			Text encode(Text t, KeyAfine k);
-			Text decode(Text t, KeyAfine k);
-
-	};
-}
-
-#endif

src/lib/codec_vigenere.cpp

@@ -1,7 +1,7 @@
 
 #include "codec_vigenere.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	CodecVigenere::CodecVigenere() : Codec() {
 	}
 

src/lib/codec_vigenere.hh

@@ -1,14 +1,14 @@
-#ifndef _LIBCRYPAFINITY_CODEC_VIGENERE_HH
-#define _LIBCRYPAFINITY_CODEC_VIGENERE_HH
+#ifndef _LIBCRYPAFFINITY_CODEC_VIGENERE_HH
+#define _LIBCRYPAFFINITY_CODEC_VIGENERE_HH
 
 #include "codec.hh"
 #include "key_vigenere.hh"
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class CodecVigenere : public Codec {
 		private:
 		public:

src/lib/cryptaffinity.hh

@@ -0,0 +1,8 @@
+#ifndef _CRYPTAFFINITY_HH
+#define _CRYPTAFFINITY_HH
+
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_proto.hh"
+
+#endif

src/lib/cryptaffinity_global.hh

@@ -1,5 +1,5 @@
-#ifndef _CRYPTAFINITY_GLOBAL_HH
-#define _CRYPTAFINITY_GLOBAL_HH
+#ifndef _CRYPTAFFINITY_GLOBAL_HH
+#define _CRYPTAFFINITY_GLOBAL_HH
 
 #include <stdlib.h>
 #include <stdio.h>

src/lib/cryptaffinity_iface.hh

@@ -0,0 +1,4 @@
+#ifndef _CRYPTAFFINITY_IFACE_HH
+#define _CRYPTAFFINITY_IFACE_HH
+
+#endif

src/lib/cryptaffinity_proto.hh

@@ -1,5 +1,5 @@
-#ifndef _CRYPTAFINITY_PROTO_HH
-#define _CRYPTAFINITY_PROTO_HH
+#ifndef _CRYPTAFFINITY_PROTO_HH
+#define _CRYPTAFFINITY_PROTO_HH
 
 #include "math_tools.hh"
 #include "alphabet.hh"
@@ -9,6 +9,6 @@
 #include "freq_analyser.hh"
 #include "codec.hh"
 #include "codec_vigenere.hh"
-#include "codec_afine.hh"
+#include "codec_affine.hh"
 
 #endif

src/lib/cryptafinity.hh

@@ -1,8 +0,0 @@
-#ifndef _CRYPTAFINITY_HH
-#define _CRYPTAFINITY_HH
-
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
-#include "cryptafinity_proto.hh"
-
-#endif

src/lib/cryptafinity_iface.hh

@@ -1,4 +0,0 @@
-#ifndef _CRYPTAFINITY_IFACE_HH
-#define _CRYPTAFINITY_IFACE_HH
-
-#endif

src/lib/freq_analyser.cpp

@@ -4,7 +4,7 @@
 
 #define DEBUG 0
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	std::list<TextCounter> FreqAnalyser::getPriorities(Text text, int keylen, int column){
 		std::list<TextCounter> result;
 		std::map<Text, int> counter;

src/lib/freq_analyser.hh

@@ -1,12 +1,12 @@
-#ifndef _LIBCRYPTAFINITY_FREQANALYSER_HH
-#define _LIBCRYPTAFINITY_FREQANALYSER_HH
+#ifndef _LIBCRYPTAFFINITY_FREQANALYSER_HH
+#define _LIBCRYPTAFFINITY_FREQANALYSER_HH
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
 #include "text.hh" // body
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 
 	class FreqAnalyser {
 		private:

src/lib/key.cpp

@@ -1,7 +1,7 @@
 
 #include "key.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	Key::Key() { }
 
 //	std::string Key::toString() { }

src/lib/key.hh

@@ -4,10 +4,10 @@
 
 //#include "text.hh"
 
-//#include "cryptafinity_global.hh"
-//#include "cryptafinity_iface.hh"
+//#include "cryptaffinity_global.hh"
+//#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class Key {
 		private:
 		public:

src/lib/key_affine.cpp

@@ -1,10 +1,10 @@
 
-#include "key_afine.hh"
+#include "key_affine.hh"
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	
 	int KeyAfine::getCoefA(){
 		return this->_a;

src/lib/key_affine.hh

@@ -1,13 +1,13 @@
 #ifndef _CRYPTAFINIY_KEYAFINE_HH
 #define _CRYPTAFINIY_KEYAFINE_HH
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
 #include "key.hh" // declaration
 #include "text.hh" // body
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class KeyAfine : public Key {
 		private:
 			int _a;

src/lib/key_vigenere.cpp

@@ -1,7 +1,7 @@
 
 #include "key_vigenere.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	KeyVigenere::KeyVigenere() : Key(), Text() { // Key()
 		int i;
 		i=0;

src/lib/key_vigenere.hh

@@ -1,13 +1,13 @@
 #ifndef _CRYPTAFINIY_KEYVIGENERE_HH
 #define _CRYPTAFINIY_KEYVIGENERE_HH
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
 #include "text.hh"
 #include "key.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class KeyVigenere : public Key, public Text {
 		private:
 		public:

src/lib/letter.cpp

@@ -1,6 +1,6 @@
 #include "letter.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 
 	Letter::Letter(const Letter &orig){
 		this->_alphabet = orig._alphabet;

src/lib/letter.hh

@@ -1,12 +1,12 @@
-#ifndef _LIBCRYPTAFINITY_LETTER_HH
-#define _LIBCRYPTAFINITY_LETTER_HH
+#ifndef _LIBCRYPTAFFINITY_LETTER_HH
+#define _LIBCRYPTAFFINITY_LETTER_HH
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
 #include "alphabet.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class Letter {
 		private:
 			Alphabet _alphabet;

src/lib/math_tools.cpp

@@ -3,7 +3,7 @@
 
 #define DEBUG 1
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	
 	int MathTools::pgcd(int a, int b){
 		int fa = a;

src/lib/math_tools.hh

@@ -1,10 +1,10 @@
-#ifndef _LIBCRYPTAFINITY_MATHTOOLS_HH
-#define _LIBCRYPTAFINITY_MATHTOOLS_HH
+#ifndef _LIBCRYPTAFFINITY_MATHTOOLS_HH
+#define _LIBCRYPTAFFINITY_MATHTOOLS_HH
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 
 	class MathTools {
 		private:

src/lib/text.cpp

@@ -2,7 +2,7 @@
 #include "text.hh"
 
 #define DEBUG 0
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	bool TextCounter::operator< (TextCounter b){
 		fflush(stdout);
 		if (this->_text.size() < b.getText().size()){

src/lib/text.hh

@@ -1,12 +1,12 @@
-#ifndef _LIBCRYPAFINITY_TEXT_HH
-#define _LIBCRYPAFINITY_TEXT_HH
+#ifndef _LIBCRYPAFFINITY_TEXT_HH
+#define _LIBCRYPAFFINITY_TEXT_HH
 
-#include "cryptafinity_global.hh"
-#include "cryptafinity_iface.hh"
+#include "cryptaffinity_global.hh"
+#include "cryptaffinity_iface.hh"
 
 #include "alphabet.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class TextCounter;
 	
 	class Text : public std::vector<int> {

src/lib/word_list.cpp

@@ -1,7 +1,7 @@
 
 #include "word_list.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	std::map<Text,int> WordList::getWordsContaining(int value){
 		std::map<Text,int> result;
 		std::map<int, TextCounter>::iterator foundVal;

src/lib/word_list.hh

@@ -4,7 +4,7 @@
 #include <map>
 #include "text.hh"
 
-namespace LibCryptAfinity {
+namespace LibCryptAffinity {
 	class WordList {
 		private:
 			std::map<Text, int>  _word2int; // existance du mot

src/runAfine.sh

@@ -1 +1 @@
-./tools/break_afinity -a tests/alphabet.txt -f 0.7 -m a -p tests/priority.txt -t tests/afine.txt -e 0.1
+./tools/break_affinity -a data/alphabet.txt -f 0.7 -m a -p data/priority.txt -t demo/affine.txt -e 0.1

src/runVigenere.sh

@@ -1 +1 @@
-./tools/break_afinity -a tests/alphabet.txt -f 0.7 -m v -p tests/priority.txt -t tests/vigenere.txt -e 0.05
+./tools/break_affinity -a data/alphabet.txt -f 0.7 -m v -p data/priority.txt -t demo/vigenere.txt -e 0.05

src/tools/Makefile.am

@@ -2,10 +2,10 @@
 
 SUBDIRS = .
 
-bin_PROGRAMS = break_afinity
+bin_PROGRAMS = break_affinity
 
 
-break_afinity_SOURCES = 	main.cpp ba_cmd.cpp ba_config.cpp file_loader.cpp ba_vigenere.cpp ba_afine.cpp
+break_affinity_SOURCES = 	main.cpp ba_cmd.cpp ba_config.cpp file_loader.cpp ba_vigenere.cpp ba_affine.cpp
 
 #	ftp_client.cpp \
 #	ftp_client_cmd.cpp \
@@ -13,7 +13,7 @@ break_afinity_SOURCES = 	main.cpp ba_cmd.cpp ba_config.cpp file_loader.cpp ba_vi
 #	miniftp.cpp \
 #	server_msg.cpp
 
-break_afinity_SOURCES += ba_cmd.hh breakafinity.hh breakafinity_global.hh breakafinity_iface.hh breakafinity_proto.hh file_loader.hh
+break_affinity_SOURCES += ba_cmd.hh breakaffinity.hh breakaffinity_global.hh breakaffinity_iface.hh breakaffinity_proto.hh file_loader.hh
 
 #	ftp_config.hh \
 #	miniftp_global.hh \
@@ -32,6 +32,6 @@ INCLUDES= 	-I../lib/ -I./ @GLIB2_CFLAGS@
 #			libyalag.la
 # miniftpc_INCLUDE = a 
 
-break_afinity_LDADD = -lcryptafinity @GLIB2_LIBS@ 
-break_afinity_LDFLAGS = 	@LDFLAGS@ -L../lib -L../lib/.libs 
+break_affinity_LDADD = -lcryptaffinity @GLIB2_LIBS@ 
+break_affinity_LDFLAGS = 	@LDFLAGS@ -L../lib -L../lib/.libs 
 

src/tools/ba_affine.cpp

@@ -4,9 +4,9 @@
 
 #define DEBUG 1
 
-namespace BreakAfinity {
+namespace BreakAffinity {
 
-	void BreakAfinity::runAfine(){
+	void BreakAffinity::runAfine(){
 		MathTools mt;
 		CodecAfine codec;
 		FreqAnalyser fa;

src/tools/ba_cmd.cpp

@@ -4,20 +4,20 @@
 
 #define DEBUG 0
 
-namespace BreakAfinity {
-	BreakAfinity::BreakAfinity(){
+namespace BreakAffinity {
+	BreakAffinity::BreakAffinity(){
 		// on fixe la config par defaut
 		int i;
 		i=i+1;
 	}
 
-	void BreakAfinity::loadFiles(){
+	void BreakAffinity::loadFiles(){
 		printf("ALIVE !!!\n");
 		this->_config.loadFiles();
 		printf("ALIVE ???\n");
 	}
 
-	void BreakAfinity::init(int argc, char **argv) {
+	void BreakAffinity::init(int argc, char **argv) {
 		int i;
 
 		for (i = 1; i + 1 < argc; i = i + 2){
@@ -60,7 +60,7 @@ namespace BreakAfinity {
 			printf("-a, --alphabet <file>      Letters ordered by decreasing frequency\n");
 			printf("-e, --epsilon <float>      Tolerance for the final key test\n");
 			printf("-f, --frequencies <float>  Average frequencies for the 9 first letters\n");
-			printf("-m, --mode ( v | a )       Choose the kind of cypher : vigenere or afine.\n");
+			printf("-m, --mode ( v | a )       Choose the kind of cypher : vigenere or affine.\n");
 			printf("-p, --priorities <file>    Letters ordered by decreasing frequency\n");
 			printf("-t, --text <file>          Cipher text to decipher\n");
 			//printf("-s, --popsize <int>      Population size in each generation\n");
@@ -71,7 +71,7 @@ namespace BreakAfinity {
 		}
 	}
 
-	void BreakAfinity::run(){
+	void BreakAffinity::run(){
 		// vigenere ou affine ?
 		MathTools mt;
 		CodecVigenere codec;

src/tools/ba_cmd.hh

@@ -1,20 +1,20 @@
-#ifndef _BREAKAFINITY_CMD_HH
-#define _BREAKAFINITY_CMD_HH
+#ifndef _BREAKAFFINITY_CMD_HH
+#define _BREAKAFFINITY_CMD_HH
 
 #include <string.h>
 #include <list>
 
-#include "breakafinity.hh"
+#include "breakaffinity.hh"
 #include "ba_config.hh"
 
 
-namespace BreakAfinity {
+namespace BreakAffinity {
 	
-	class BreakAfinity {
+	class BreakAffinity {
 		private:
 			BreakerConfig _config;
 		public:
-			BreakAfinity();
+			BreakAffinity();
 			void init(int argc, char ** argv);
 			void loadFiles();
 			void run();

src/tools/ba_config.cpp

@@ -2,7 +2,7 @@
 #include "ba_config.hh"
 #include "file_loader.hh"
 
-namespace BreakAfinity {
+namespace BreakAffinity {
 	void BreakerConfig::setMode(char * m){
 		switch(m[0]){
 			case 'v':

src/tools/ba_config.hh

@@ -1,5 +1,5 @@
-#ifndef _BREAKAFINITY_CONFIG_HH
-#define _BREAKAFINITY_CONFIG_HH
+#ifndef _BREAKAFFINITY_CONFIG_HH
+#define _BREAKAFFINITY_CONFIG_HH
 
 #include <string>
 #include <vector>
@@ -8,9 +8,9 @@
 #include "alphabet.hh"
 #include "text.hh"
 
-using namespace LibCryptAfinity;
+using namespace LibCryptAffinity;
 
-namespace BreakAfinity {
+namespace BreakAffinity {
 	class BreakerConfig {
 		private:
 			bool _modeVigenere;

src/tools/ba_vigenere.cpp

@@ -4,9 +4,9 @@
 
 #define DEBUG 0
 
-namespace BreakAfinity {
+namespace BreakAffinity {
 
-	void BreakAfinity::runVigenere(){
+	void BreakAffinity::runVigenere(){
 		MathTools mt;
 		CodecVigenere codec;
 		FreqAnalyser fa;
@@ -17,7 +17,7 @@ namespace BreakAfinity {
 		int alpha_size = this->_config.getAlphabet().size();
 
 		// 1 - repérer les mots qui se répentent
-		pDEBUG("BreakAfinity::run","analysing %s\n",cypherText.toString().c_str());
+		pDEBUG("BreakAffinity::run","analysing %s\n",cypherText.toString().c_str());
 		KeyVigenere key;
 		TextCounter fst;
 		TextCounter sec;
@@ -49,7 +49,7 @@ namespace BreakAfinity {
 
 		// 2 - on en déduit la longueur de la clef
 		key_len = mt.pgcd(dist1,dist2);
-		pDEBUG("BreakAfinity::run","PGCD(%d, %d) = %d\n", dist1, dist2, key_len);
+		pDEBUG("BreakAffinity::run","PGCD(%d, %d) = %d\n", dist1, dist2, key_len);
 
 		// 3 - on calcule le décalage par colonne
 		std::list<TextCounter>::iterator pI;

src/tools/breakaffinity.hh

@@ -0,0 +1,8 @@
+#ifndef _BREAKAFFINITY_HH
+#define _BREAKAFFINITY_HH
+
+#include "breakaffinity_global.hh"
+#include "breakaffinity_iface.hh"
+#include "breakaffinity_proto.hh"
+
+#endif

src/tools/breakaffinity_global.hh

@@ -1,10 +1,10 @@
-#ifndef _BREAKAFINITY_GLOBAL_HH
-#define _BREAKAFINITY_GLOBAL_HH
+#ifndef _BREAKAFFINITY_GLOBAL_HH
+#define _BREAKAFFINITY_GLOBAL_HH
 
 #include <stdio.h>
 #include <stdlib.h>
 
-#include "cryptafinity.hh"
+#include "cryptaffinity.hh"
 
 #define COLOR_GREEN "\x1B[33m"
 #define COLOR_NORMAL "\x1B[0m"

src/tools/breakaffinity_iface.hh

@@ -0,0 +1,4 @@
+#ifndef _BREAKAFFINITY_IFACE_HH
+#define _BREAKAFFINITY_IFACE_HH
+
+#endif

src/tools/breakaffinity_proto.hh

@@ -1,5 +1,5 @@
-#ifndef _BREAKAFINITY_PROTO_HH
-#define _BREAKAFINITY_PROTO_HH
+#ifndef _BREAKAFFINITY_PROTO_HH
+#define _BREAKAFFINITY_PROTO_HH
 
 #include "ba_cmd.hh"
 #include "ba_config.hh"

src/tools/breakafinity.hh

@@ -1,8 +0,0 @@
-#ifndef _BREAKAFINITY_HH
-#define _BREAKAFINITY_HH
-
-#include "breakafinity_global.hh"
-#include "breakafinity_iface.hh"
-#include "breakafinity_proto.hh"
-
-#endif

src/tools/breakafinity_iface.hh

@@ -1,4 +0,0 @@
-#ifndef _BREAKAFINITY_IFACE_HH
-#define _BREAKAFINITY_IFACE_HH
-
-#endif

src/tools/file_loader.cpp

@@ -1,9 +1,9 @@
 
 #include "file_loader.hh"
 
-using namespace LibCryptAfinity;
+using namespace LibCryptAffinity;
 
-namespace BreakAfinity {
+namespace BreakAffinity {
 	std::vector<int> FileLoader::loadPriorities(
 			std::map<std::string, int> reverse_alpha, 
 			std::string filename){

src/tools/file_loader.hh

@@ -10,9 +10,9 @@
 #include "alphabet.hh"
 #include "text.hh"
 
-using namespace LibCryptAfinity;
+using namespace LibCryptAffinity;
 
-namespace BreakAfinity{
+namespace BreakAffinity{
 	class FileLoader {
 		private: 
 		public:

src/tools/main.cpp

@@ -1,11 +1,11 @@
 
-#include "breakafinity.hh"
+#include "breakaffinity.hh"
 #include "ba_cmd.hh"
 
-using namespace BreakAfinity;
+using namespace BreakAffinity;
 
 int main(int argc, char ** argv){
-	::BreakAfinity::BreakAfinity br_af;
+	::BreakAffinity::BreakAffinity br_af;
 	
 	br_af.init(argc, argv);
 	br_af.loadFiles();